Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms