Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms