Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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