Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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