Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CftrP26361 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CftrP26361 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CftrP26361 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CftrP26361 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CftrP26361 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CftrP26361 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CftrP26361 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CftrP26361 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CftrP26361 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CftrP26361 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CftrP26361 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CftrP26361 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CftrP26361 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CftrP26361 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms