Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms