Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms