Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PparaP23204 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PparaP23204 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PparaP23204 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PparaP23204 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms