Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpcP21841 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms