Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxb9P20615 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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