Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms