Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P20040 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P20040 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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