Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms