Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RargP18911 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms