Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P18530 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P18530 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P18530 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P18530 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P18530 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P18530 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P18530 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P18530 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P18530 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P18530 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P18530 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18530 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms