Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms