Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Selenbp1P17563 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms