Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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