Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms