Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54P14576 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54P14576 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms