Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms