Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms