Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DmdP11531 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DmdP11531 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DmdP11531 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DmdP11531 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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DmdP11531 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DmdP11531 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DmdP11531 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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