Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms