Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UbbP0CG49 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms