Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms