Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp1P08042 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp1P08042 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms