Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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TtrP07309 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TtrP07309 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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