Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa4P06798 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms