Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms