Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01673 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01673 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01673 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01673 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01673 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01673 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01673 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01673 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms