Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01641 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01641 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01641 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01641 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms