Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl2O89104 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms