Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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