Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopeO89079 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CopeO89079 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CopeO89079 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CopeO89079 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopeO89079 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms