Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BlmO88700 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BlmO88700 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BlmO88700 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BlmO88700 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BlmO88700 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BlmO88700 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms