Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms