Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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