Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnk4O88454 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms