Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtssO70370 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtssO70370 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms