Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms