Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgceO70258 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgceO70258 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgceO70258 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgceO70258 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms