Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChkbO55229 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms