Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif6O55135 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif6O55135 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms