Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms