Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlkO54988 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlkO54988 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SlkO54988 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SlkO54988 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SlkO54988 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SlkO54988 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlkO54988 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms