Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms