Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Socs5O54928 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms