Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EomesO54839 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EomesO54839 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EomesO54839 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EomesO54839 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EomesO54839 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EomesO54839 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EomesO54839 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EomesO54839 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EomesO54839 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EomesO54839 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EomesO54839 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EomesO54839 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EomesO54839 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EomesO54839 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms