Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms